1x01 Pilot
(Lány a tóban)

A Dr. Csont sorozat első része, Brennan első ügye egy tóból kihalászott, ismeretlen csontvázhoz kapcsolódik, amiről rögtön megállapítja, hogy hány éves, illetve hogy teniszezni is tudott

1x02 The Man in the S.U.V.
(Robbanó méreg)

Hirtelen robbanás tép darabokra egy autót,  és a helyszínen méregnyomokat is találnak.

1x03 A Boy in a Tree
(Egy iskola titkai)

Egy előkelő bentlakásos középiskolában, ahová fontos emberek és védett személyek gyermekei járnak, napok óta oszló holttestet találnak egy fára akasztva.

1x04 A Man in the Bear
(A medve-ügy)

Egy északi, hegyvidéki körzetben orvvadászoktól lelőtt medve tetemét találja meg a helyi erdész. Amikor az állatorvos megvizsgálja a tetemet, legnagyobb megdöbbenésére emberi kéz maradványa kerül elő belőle.

1x05 A Boy in a Bush
(Örökbefogadott Halál)

Azonosítatlan gyerekholttestre bukkannak egy külvárosi bevásárlóközponttól nem messze fekvő elhagyatott mezőn.

1x06 The Man in the Wall
(Múmia a falban)

Brennan és Angela együtt mennek mulatni egy bárba, ahol hirtelen összeszólalkoznak a többi vendéggel, és a csetepaté eredményeként ledől egy válaszfal, ami mögül mumifikálódott holttest bukkan elő.

1x07 The Man on Death Row
(A Halálraítélt)

Amy, a fiatal, agilis ügyvédnő, aki nem éppen Booth szíve csücske, arra kéri a férfit, hogy segítsen elhalasztatni annak a gyilkosnak a kivégzését, akit egykor  ő tartóztatott le.

1x08 The Girl in the Fridge
(A példakép)

Brennant meglátogatja régi tanára az egyetemről, aki egykor a példaképe, mentora, és szeretője is volt. A nosztalgiánál is fontosabbá válik azonban hamarosan egy gyilkossági ügy, amelyben az áldozatot azonosító Brennannel Michael hamar ellenkezni kezd, és a doktornőnek nemsokára azt is meg kell tudnia, hogy a férfi, akiben megbízik, a vádlottak szakértő tanúja, és nem is mindig tiszta eszközökkel küzd ellenük.

1x09 The Man in the Fallout Shelter
(Karácsonyi Karantén)

Karácsony előtt egy nappal Booth beállít az intézetbe egy csontvázzal, amelyet egy ház alá épített óvóhelyen találtak. A csontok vizsgálata közben elszabadul egy fertőző anyag, ami után az egész laboratórium hermetikus karantén alá kerül, és a csapatnak nincs más választása, mint együtt tölteni a karácsonyt.

1x10 The Woman at the Airport
(Szétszóródva)

A Los Angeles-i nemzetközi repülőtéren - több helyen elrejtve - ismeretlen nő maradványaira bukkannak. Booth és Brennan a helyszínre siet, és hamarosan kiderítik, hogy az áldozat prostituáltként dolgozó fiatal lány volt, akivel kegyetlenül végeztek

1x11 The Woman in the Car
(A koronatanú)

Booth és Brennan egy gépkocsitűz után arra utaló nyomokat találnak, hogy a bennégett sofőrnek lehetett egy gyereke, akit elraboltak.

1x12 The Superhero in the Alley
(Szuperhős a sikátorból)

Fiatal fiú bomló tetemét találják meg egy sikátorban. A nyomozás hamarosan kideríti, hogy Warren Granger magányos kamasz volt, aki a szerepjátékokban találta meg a valódi életét.

1x13 The Woman in the Garden
(Csontváz a csomagtartóban)

Közlekedési rendőr állít meg egy autót, majd annak átvizsgálásakor kiderül, hogy a csomagtartóban egy hónapokkal korábban elhunyt, földdel borított női csontváz található.

1x14 The Man on the Fairway
(Egy kínos ügy)

Egy vidéki golfpályára magángép zuhan le, és Dr. Brennan csapatát kérik fel a maradványok azonosítására. Az ügy politikailag is kényes, mivel a gépen utazott egy külügyminisztériumi tisztviselő, és két magasrangú kínai diplomata.

1x15 Two Bodies in the Lab
(Két titokzatos hulla)

Évek óta bomló hullát találnak, és a körülmények egyértelműen arra utalnak, hogy maffia-leszámolás áldozata lett az illető. Booth kollégája, aki egykor a nyomozást vezette, bekapcsolódik a munkába, és Booth-nak meg is van a gyanúsítottja, aki már korábban is sok ügyet megúszott bizonyíthatóság hiányában. Amikor Brennant támadás éri, világossá válik, hogy valaki nagyon szeretné elkerülni a gyilkos azonosítását.

1x16 The Woman in the Tunnel
(Az eltemetett titkok)

A Washington utcaszintje alatti alagutak és járatok labirintusában több napja oszló hullát találnak. Booth és Brennan, akik a helyszínre sietnek, egész kis föld alatti hajléktalan-társadalmat fedeznek fel, akik saját törvényeik szerint élnek.

1x17 The Skull in the Desert
(Koponya a sivatagban)

Angela, aki fiújával a mexikói határ közelében fekvő sivatagban vakációzik, aggódva hívja fel Brennant, ugyanis a barátja, Kirk és bennszülött vezetője napok óta eltűnt. Amikor egy lecsupaszított koponya kerül elő, Angela a legrosszabbtól tart, és megkéri Brennant, utazzon a helyszínre, hogy felderítse az ügyet.

1x18 The Man with the Bone
(A kalózok kincse)

Megölnek egy férfit, aki egy Washingtonhoz közeli szigeten dolgozott egy kincskereső-expedíciónál. Brennan a holttest vizsgálatakor felfedez egy csontdarabot, ami nem a hullához tartozik, és hamarosan kiderül: egy 300 éves csontvázból származik a lelet.

1x19 The Man in the Morgue
(Feketemágia)

Brennan a Katrina-hurrikántól elpusztított New Orleans-ban segít az árvíz áldozatainak azonosításában. Egy napon, miután különös, azonosítatlan holttestre bukkantak, és miután kollégájával töltötte az estét, reggel csurom véresen tér magához, és nem emlékszik semmire.

1x20 The Graft in the Girl
(Gyilkos átültetés)

Cullen FBI-igazgatóhelyettes kamaszlánya súlyos tüdőrákban szenved, amikor Booth és Brennan meglátogatják. A kislányt látva Brennan-nek azonnal gyanús lesz, hogy a kór minden előzmény nélkül, egy csonttörést követő operációnál beültetett szövet nyomán alakulhatott ki.

1x21 The Soldier on the Grave
(Egy becsületbeli ügy)

Booth és Brennan az arlingtoni nemzeti katonai temetőben történt halálesetet vizsgál. Egy iraki háborús hős sírjánál gyújtotta fel magát valaki.

1x22 The Woman in Limbo
(Családban marad)

Brennan-nek az intézetben ismeretlen nő csontjait kell azonosítania, ám döbbenete annál nagyobb, amikor kiderül, hogy az illető nem más, mint saját anyja, aki még kamaszkorában tűnt el.