5x01 Harbringers in the Fountain
(A szökőkút mélyén)

Már 6 hete, hogy Brennan és Booth utoljára látták egymást ám első közös ügyük sok akadály elé állítja őket, beleértve Angela jósnőjét és Booth bizonyítási vágyát.

5x02 The Bond in the Boot
(Kémek krémje)

Brennan és Booth egy macskák által felfalt áldozat után kell nyomozniuk, akit egy aktatáskáért öltek meg. Booth továbbra is szenved, hogy "visszanyerje" önmagát az agyműtétje után.

5x03 The Plain in the Prodigy
(A tehetség átok)

Levi Yoder egy Ámish társaság egyik tagjának holttestét találja meg a vasút mellett.

5x04 The Beautiful Day in the Neighborhood
(Jószomszédi iszony)

Emberi maradványokat találnak egy partin és a Jefferson intézetet hívják először.

5x05 A Night at the Bones Museum
(Éjszaka a múzeumban)

Egy áramos kerítésen találnak egy igazi múmiát, ami elvezeti Boothékat a Jefferson Intézet Egyiptologiai részlegére, ahol viszont egy friss hullát találnak..

5x06 The Tough Man in the Tender Chicken
(Gyilkos üzem)

Egy csirke farmer maradványait találják egy folyó partján, a farmer viszont egy állat jogi-aktivista volt, aki éppen egy csirkegyárat készült örökölni, így sok mindenki akarta holtan látni...

5x07 The Dwarf in the Dirt
(Balszerencsés kobold)

Booth és Brennan egy törpe gyilkosságán dolgozik. Booth-nak az az érzése, hogy a műtétje után már nem olyan jó mesterlövész. És feltűnik régi ismerősünk Dr. Gordon Wyatt is...

5x08 The Foot in the Foreclosure
(Orr és Hamu)

Egy ingatlanügynök emberi maradványokat fedez fel, amíg egy házat mutat be, a csapatot kapja a nyomozást. Időközben Booth nagyapja beköltözik unokájához és vele marad a nyomozás végéig...

5x09 The Gamer in the Grease
(A világbajnok postás esete)

Brennan-t és Booth-t egy játékfüggő halálának körülményeinek vizsgálatához hívják ki.

5x10 The Goop on the Girl
(Bankrabló Mikulás)

Booth és Brennan egy Télapó ruhában bankot rabolni készülő áldozat ügyében nyomoznak, akit fel is robbantottak. Közben visszatér Brennan apja egy távoli rokonnal, Margarettel...

5x11 The X in the File
(Ufóból is megárt a sok!)

Booth és Brennan a mexikói határhoz utazik egy gyilkosság miatt. Furcsa módon a kis városkában mindenki azt gondolja, hogy a halott ufó volt.

5x12 The Proof in the Pudding
(Csontok a Fehér Házból)

Ellepik a Jefferson Intézetet a kormány ügynökei és kötelezik a csapatot, hogy határozzák meg egy ismeretlen áldozat halálának az okát, az információk pedig bizalmasak. Még Booth-t is ki kell zárniuk az ügyből, aki persze mindent megtesz, hogy bejusson a Jeffersonba.

5x13 The Dentist in the Ditch
(Fogas Kérdés)

Egy régi polgárháborús csatamezőn találnak egy csontvázat, és rögtön Booth-t és Brennan-t hívják a helyszínre. A helyszínen Bones azonnal megállapítjai, hogy friss a csontváz.

5x14 The Devil in Details
(Az ördög a részletekben rejlik)

Booth és Brennan egy egyedülálló holttest ügyében dolgoznak, a helyszín pedig nem más, mint egy templom. Arastoo Vaziri, Brennan egyik gyakornokának a múltjáról derülnek ki egyes dolgok...

5x15 The Bones on a Blue Line
(Meglepetés az alagútból)

60.000. gallon víz szabadul ki egy metró "balesetnél". A felszínre kerül ennek köszönhetően egy áldozat. Mindeközben Sweets egy metró kocsiban raboskodik...

5x16 The Parts in the Sum of the Whole
(még nem került adásba Mo.-n)

A 100. részben a sorozat készítői, visszaviszik a nézőket 6 évvel ezelőttre, hogy láthassuk, hogyan ismerkedett meg Booth és Brennan és hogy mi is volt a legelső ügyük együtt. Sweets pedig bogarat ültet Booth fülébe, aminek meg is lesz a következménye...

5x17 The Death of the Queen Bee
(még nem került adásba Mo.-n)

A csapat újabb ügye visszavisz minket Brennan középiskolájába, a Burtonsville High Schoolba, ahol is egy koponyát és egy felsőtestet találtak. Booth már óvatosabb Brennan-nal az előző résznek köszönhetően.

5x18 The Predator in the Pool
(még nem került adásba Mo.-n)

Bootht és Brennant kérik fel, egy személy azonosítására, akit egy cápa gyomrában találtak. Mivel arra utaló bizonyítékot találnak, hogy az áldozatból több féle hal is falatozott az akváriumban folytatódik a nyomozás.

5x19 The Rocker in the Rinse Cycle
(még nem került adásba Mo.-n)

Brennan és Booth egy Rock 'N Roll fantáziatáborban történt haláleset után nyomoznak...

5x20 The Witch in the Wardrobe
(még nem került adásba Mo.-n)

Két holttestre kerül elő, amikor leég egy erdei kunyhó, az egyik áldozat egy modern kori boszorkány, a másik viszont a salemi boszorkányperek idejéből való.

5x21 The Boy with the Answer
(még nem került adásba Mo.-n)

Elérkezett a Sírásó bírósági perének napja, és éjjel-nappal mindenki azon dolgozik, hogy olyan bizonyítékot találjanak, aminek köszönhetően a sorozatgyilkos élete végéig börtönben marad.

5x22 The Beginning in the End
(még nem került adásba Mo.-n)

A csapat jól eltemetett nyomokat próbál felderíteni, miközben megjelenik Angela apja is némi különleges céllal. Brennan és Booth pedig hatalmas választás elé kerül, ami  örökre megváltoztatja az életüket és partneri viszonyukat....