4x01 Yanks in the UK I.
(Jenkik Angliában 1. rész)

Amikor Brennan oxfordi meghívója, egy fiatal és agilis tanár hívást kap, hogy hullát találtak a Temzében, a helyszínre siet két amerikai vendégével együtt. 

4x02 Yanks in the UK II.
(Jenkik Angliában 2. rész)

Brennan oxfordi barátját holtan találják, így Bones és Booth ott marad Angliában, hogy segítsen Prichard nyomozónak megtalálni a gyilkost.

4x03 The Man in the Outhouse
(Hűtlenek és Holtak)

Egy nagyon híres reality műsorvezető testét találják meg egy wc-ben, Bones és Booth a gyilkost próbálják megtalálni.

4x04 The Finger in the Nest
(Állati Nyomozás)

Booth fia, Parker, egy hulla egyik ujját találja meg egy madárfészekben, ezáltal a csapat nyomozást indít, hogy megtalálják a test többi részét.

4x05 The Perfect Pieces in the Purple Pond
(Segítség a Zártosztályról)

Egy darabokra szedett holttestet találnak egy nagy adag lila vízben, minden meg van,kivéve a hulla fejét.

4x06 The Crank in the Shaft
(Munkahelyi Szerelem)

Egy liftbe zuhan egy láb, a test többi részét a liftaknában találják meg. Booth és Brennan rá kell,hogy jöjjön, hogy az irodaház melyik alkalmazottja ölte meg az áldozatot.

4x07 The He in the She
(Férfi vagy Nő?)

A Chesapeake-öbölben találnak egy felső testet, nem könnyű feladat elé állítva Brennan-t, amikor megtalálják a test többi részét újabb problémák kerülnek elő a hulla identitását övezően.

4x08 The Skull in the Sculpture
(Halál Szobrász)

Egy furcsa művészeti darab egy hullát rejt magában. Szemétből összerakott műremekek, melyek több ezer dollárt érnek rendesen megnehezítik a csapat munkáját, mivel nem férhetnek rendesen hozzá a hullához.

4x09 The Con Man in the Meth Lab
(Szélhámos a Laborban)

Egy rendőr gyakorlatot tart diákjainak, amikor egy szénné égett hulla kerül elő, természetesen Booth-t és Brennan-t hívják a helyszínre.

4x10 The Passenger in the Oven
(Ég és Föld között)

Brennan Booth társaságában Kínába tart, hogy egy 40.000 éves csontvázat azonosítson, ám a repülőn gyilkosság történik, ami csak addig tartozik az FBI hatáskörébe, amíg a repülő a levegőben van.

4x11 The Bone that Blew
(Elfújta a Szél)

Brennan apja állást kap a Jefferson intézetben, és amikor segít egy nyomozásban Bones ki akarja rúgni.

4x12 Double Trouble in Panhandle
(Kész Cirkusz)

Egy sziámiikerpár halála arra kényszeríti Brennan-t és Booth-t, hogy álruhában csatlakozzanak egy vándorcirkuszhoz, hogy felderíthessék az ügyet.

4x13 Fire in the Ice
(Tűz és Jég)

Egy jégbefagyott hullát találnak pár hónappal egy hokimeccs után, ahol Booth és az áldozat összeszólalkozott. Booth-nak tisztáznia kell magát és ehhez Bones segítségére van szüksége.

4x14 The Hero in the Hold
(Ügynökrablás)

Visszatér a Sírásó és elrabolja Booth-t. A csapaton a sor, hogy megtalálja mielőtt kifogyna az időből. Azonban a váltságdíj most nem pénz, hanem bizonyíték formájában lett megszabva.

4x15 The Princess and the Pear
(A hercegnő halála)

A csapat gyilkossági nyomozást indít, amikor egy hercegnőt középkori ruhákban holtan találnak. Booth háta megsérült, így Payton Perotta ügynök segíti a nyomozást.

4x16 The Bones that Foam
(Habzó csontok)

A csapatnak rövid ideje van megtalálni a gyilkost amikor az egyik áldozat csontjai habzást követően folyamatosan lebomlanak.

4x17 The Salt in the Wounds
(A jéghegy csúcsa)

Brennan és Booth egy halott 16-éves lány ügyében nyomoznak és furcsa felfedezésre jutnak az áldozat sulijában.

4x18 The Doctor in the Den
(Hulla vacsorára)

A szafari parkban tigristápláléknak dobtak ki egy férfit, holttestét Angela azonosítja és kiderül, hogy Cam 10 évvel ezelőtti vőlegénye az.

4x19 The Science in the Physicist
(Gyilkos tudós)

Egy szemetesben talált áldozat fülében fura anyagot találnak. Emiatt Brennan és Booth egy híres intézetbe látogatnak el, ahol Booth kényelmetlenül érzi magát a sok "agyas" között.

4x20 The Cinderella in the Cardboard
(Végzetes Randi)

Egy újrahasznosító üzemben egy szétpréselt hullát találnak és a Jefferson intézet csapatát hívják ki nyomozni.

4x21 Mayhem on a Cross
(Keresztre feszítve)

Brennan és Booth egy metálrock énekes gyilkossági ügyét vizsgálják. Eközben Sweets könyvet kezd el írni Booth-ról és Brennan-ról és Dr. Gordon Wyatt segítségét kéri a kezdetekhez.

4x22 The Double Death of the Dearly Departed
(Drága Szeretteim)

Egy Jefferson intézeti munkatárs szívinfarktusban elhalálozik. A virrasztáson Brennan a holttest láttán meg van győződve arról, hogy nem véletlen volt a férfi halála. Nyomozást kell indítani, de mindezt a gyászolók tudta nélkül.

4x23 The Girl in the Mask
(Álarc mögött)

Brennan és Booth Sachi után nyomoznak. Sachi Booth egyik nyomozóbarátjának Ken-nek a húga, Japánból. A lány eltűnik amikor az USA-ba érkezik és amikor megtalálják a levágott fejét, már semmi jót sem várnak az ügytől.

4x24 The Beaver in the Otter
(Hullajó buli)

Booth és Bones egy Beaver nevű pasas ügyén dolgoznak. Eközben Booth segít a testvérének új állást találni.

4x25 The Critic in the Cabernet
(Borban az igazság)

A Jefferson intézet egy bor-kritikus halálát vizsgálja. Brennan sokkolja Booth-t azzal a hírrel, hogy gyereket szeretne tőle mesterséges úton. Booth nem tud nem erre gondolni a munka közben. A stressz és a még nem diagnoztizált egészségügyi problémája hallucinációt okoz Booth-nak, mire Brennan elrángatja a kórházba.

4x26 The End in the Beginning
(A vég kezdete)

A negyedik évad fináléjában egy holttestet találnak egy közkedvelt nightclub-ban, a "Labor"-ban. A Jefferson csapat különös szerepet kap ebben a furcsa részben.