2x01 The Titan on the Tracks
Vakvágányon)

Booth és Brennan egy vasúti szerencsétlenség helyszínén nyomoz, ahol a vonat által elütött gépkocsi vezetőjéről kiderül, multimilliomos volt. Mivel a balesetben életét vesztette egy szenátor is, az ügy kényessé válik, főleg, amikor felmerül a pénzügyi spekuláció lehetősége, és kétségek támadnak a halott kilétét illetően.

2x02 Mother and Child in the Bay
(Bizonyíték Híján)

Egy évvel korábban eltűnt fiatal nő hulláját találják meg egy tengeröbölben, és Booth azonnal nyomozni kezd, mivel a nő férjét korábban is gyanúba fogták, de nem találtak ellene bizonyítékot.

2x03 The Boy in the Shroud
(Az utcagyerek)

Oszlóban levő fiatalember hulláját találják meg egy balesetet szenvedett kukásautóban. A nyomozás kideríti, hogy az illető jó családból származó fiú volt, aki egyetemre készült.

2x04 The Blonde in the Game
(Halálos Játszma)

Azonosítatlan hullára bukkannak egy erdőben, s Brennan a nyomokból arra következtet, hogy kezét-lábát összekötözve kínozták meg. Amikor kiderül, hogy az áldozat szőke, fiatal lány volt, Booth-szal rádöbbennek, hogy a módszer Howard Epps-re vall, a sorozatgyilkosra, akit akaratukon kívül is megmentettek a kivégzéstől.

2x05 The Truth in the Lye
(Egy férfi és három nő)

Maró savas anyaggal teliöntött kádban találnak egy férfi alig azonosítható hullájára. A nyomozás során Booth és Brennan apránként rájönnek, hogy a férfinak két felesége is volt két különböző városrészben, majd felbukkan egy harmadik lány, akinek szintén viszonya volt vele.

2x06 The Girl in Suite 2103
(Diplomáciai bonyodalmak)

Hatalmas robbanás történik egy szállodai lakosztályban, amelynek áldozatul esik több, kábítószer-kereskedelem ellen küzdő dél-amerikai. A kolumbiai nagykövetség igazságügyi attaséja csak szerencsével ússza meg a robbantást, ám kiderül, hogy a detonáció középpontjánál holtan talált fiatal nővel viszonya volt a diplomata fiának.

2x07 The Girl with Curl
(Gyilkos Szépségverseny)

Egy szennyvíztisztító műben kerül elő egy hónapokkal korábban eltűnt kislány oszlóban levő holtteste. Hamarosan kiderül, hogy az alig 9 éves Brianna rendszeresen gyermek-szépségversenyeken indult, és a győzelem érdekében ő, valamint anyja mindent bevetett és vállalhatónak tartott.

2x08 The Woman in the Sand
(A kocka el van vetve)

Egy öt évvel korábban meggyilkolt ügyész csontjaira talál a rendőrség a Las Vegas melletti sivatagban. Amikor Booth és Brennan a helyszínre érkeznek, hamarosan felfedeznek a közelben egy másik hullát, melyet csak pár nappal korábban vihetett oda a tettes.

2x09 Aliens in a Spaceship
(Élve eltemetve)

Egy légmentesen zárt fémtartályban két mumifikálódott holttestet találnak. A nyomozás során kiderül, hogy a Sírásó élve temeti el áldozatait, és így csikar ki váltságdíjat a hozzátartozókból. Amikor Brennan és Hodgins a vizsgálat során túl közel kerülnek a megoldáshoz, egy autóba térnek magukhoz, élve eltemetve a föld alatt.

2x10 The Headles Witch in the Woods
(Egy boszorkányos ügy)

Fej nélküli hullára bukkannak egy sűrű erdő mélyén, amelyben a helybéli legendák szerint egy boszorkány kísért, akit 200 évvel korábban lefejeztek, és ezért jár vissza.

2x11 Judas on a Pole
(Az árulók büntetése)

Booth-nak egy harminc évvel korábbi bűnügy aktáit kell újra megnyitnia, amikor egy volt FBI-ügynök elszenesedett holttestére bukkannak.

2x12 The Man in the Cell
(A játék neve: Halál)

Howard Epps, a halálos ítélete végrehajtását váró sorozatgyilkos, akit Brennan segítségével juttattak rács mögé, tüzet okoz a börtönben, és a felfordulásban megszökik.

2x13 The Girl in the Gator
(A mocsár titka)

A floridai Everglades-mocsárban egy aligátorban találják meg egy eltűnt egyetemista lány maradványait. Brennan azonnal a helyszínre siet, de nélkülöznie kell Booth társaságát, akit egy agresszív kitörése után az FBI pszichiáterhez rendelt, mielőtt ismét fegyvert adnának a kezébe.

2x14 The Man in the Mansion
(Szex, hazugság, gyilkosság...)

Otthonában találják meg egy gazdag vállalkozó bomlófélben levő hulláját, aki egy ifjúsági központot vezetett, ahol problémás gyerekeket igyekeztek a jó útra terelni. Kiderül, hogy az egyik kábítószer-árus fiútól, akitől elvette a heroint, szintén megölték.

2x15 Bodies in the Book
(Ahogy a nagy könyvben meg van írva)

A kikötő vizében talált hulláról hamar kiderül, hogy pontosan úgy gyilkolták meg, és rejtették el, ahogyan azt a Brennan legújabb könyvében szereplő sorozatgyilkos tette.

2x16 The Boneless Bride in the River
(A csont nélküli tetem)

Egy folyóba dobott ládában igen szokatlan tetemet találnak: az összeesett bőr alól valaki az ismeretlen nő minden csontját eltávolította. A nyomozás során kiderül, hogy a fiatal lány Kínából érkezett az Egyesült Államokba egy menyasszony-közvetítő cégen keresztül, de végül nem ment férjhez választottjához.

2x17 The Priest in the Churchyard
(Halál a parókián)

Egy plébánia temetőjében több különös holttest is a felszínre kerül. A helyi pap állítása szerint már évtizedek óta nem temettek ide embereket, a megtalált férfi azonban mindössze három éve halhatott meg.

2x18 The Killer in the Concrete
(Egy kemény ügy)

Egy lebetonozott területen cementbe öntött hulla maradványaira bukkannak, amelyet később egy veszélyes bérgyilkos holttesteként azonosítanak. A nyomozás során Booth rájön, hogy a halott bérgyilkos hírhedt társa mégis él.

2x19 Spaceman in a Crater
(Az égből pottyant űrhajós)

Felismerhetetlenségig szétzúzódott holttestre talál egy farmer a földjén, ami az égből zuhant le nagy sebességgel. Hodgins, az összeesküvés-elméletek híve biztos abban, hogy a válaszokat a NASA-nál kell keresni, a 130 évesnek tűnő áldozat ugyanis csak űrhajós lehetett.

2x20 The Glowing Bone in the Old Stone House
(Fénylő Csontok)

Egy elhagyatott fészerben titokzatosan fénylő csontvázat találnak, amelyről patkányok rágták le félig a húst. Az első ijedtség után kiderül, hogy a tetem nem radioaktív, és Cam nekilát az azonosításnak.

2x21 Stargazer in a Puddle
(Csillgahullás)

Egy leeresztett víztározóban gyermekholttestre bukkannak, az arcát azonban Angela egy korai öregedést okozó betegség miatt idős asszony arcaként rekonstruálja. A nyomozás során hamar a szellemileg visszamaradt lány gondozójára terelődik a gyanú, amely azonban nagyon gyenge lábakon áll.